La création de ce musée eut pour but d’exposer et d’expliquer les objets retrouvés dans la Lagune du Condor : principalement des momies, mais aussi un grand nombre d’objets funéraires. C’est également un centre de recherche archéologique et anthropologique majeur dans la région, et il expose différentes pièces (céramiques, tissus, etc.) des différentes civilisations qui ont vécu dans la région.